简介
GTDB-Tk 的输入文件是基因组的fasta文件。它会使用 Prodigal (Hyatt et al., 2010) 预测基因， 使用HMMER (Eddy, 2011) 鉴定出细菌的120个单拷贝标记基因或者古菌的122个标记基因来构建进化树进行分类。
- 官网：https://gtdb.ecogenomic.org/
- 第三方工具：https://gtdb.ecogenomic.org/tools
- Github地址：https://github.com/Ecogenomics/GtdbTk
