简介
植物中基因复制方可能是全基因组复制、串联复制、近端复制、转座复制或分散复制。这些机制产生的重复基因在基因组中的丰度、选择压力、表达差异和基因转化率方面存在差异。
- WGD产生的重复基因数量随着时间呈指数下降
- 转座复制和分散复制来源的基因并行下降
- 串联复制和近端复制的频率随时间没有显著减少,为环境适应提供了遗传基础。相比其他重复方式,这类基因经历了更强的选择压力
动物中的基因复制类型也可参考使用。
DupGen_finder
安装
github:https://github.com/qiao-xin/DupGen_finder